Når du tjekker ind manuelt ved skranken i lufthavnen, skal du kunne vise/opgive flyselskabets referencenummer (som står på din flybillet) sammen med gyldig legitimation/pas/visum. Du får herefter udleveret dit boardingkort og kan fortsætte videre gennem sikkerhedskontrollen og til din gate.
Du kan hos visse selskaber også tjekke ind på automaterne i lufthavnen blot ved at indtaste dit referencenummer. Du får herefter dit/dine boardingkort direkte fra automaten sammen med bagagemærker, som du skal sætte fast på den bagage, du vil tjekke ind.
Visse flyselskaber (Ryanair og Wizzair) kræver, at du tjekker ind online og printer dine boardingkort, inden du ankommer til lufthavnen. Hvis du ikke gør dette, skal du som rejsende betale ekstra omkostninger. På din flybillet er det udførligt skrevet, hvordan du skal gøre.